يقسم القسم إلى:
القسم الداخلى – العيادات الخارجية – ثلاث وحدات (العناية المركزة – القسطرة المخية – رسم المخ)، ويضم كلًا منهم التالى:
رســم المـــخ
القسطرة المخية
العناية المركزة
العيادات الخارجية
القسم الداخلى
رســم المـــخ
جهاز نيهون كودن لرسم المخ بالكمبيوتر مع وجود جهاز الأشعة التليفزيونية على شرايين وأورده المخ (Carotid Doppler).
القسطرة المخية
جهاز القسطرة المخية لعمل القساطر التشخيصية والعلاجية على شرايين وأورده المخ.
العناية المركزة
تتكون من غرفة واحدة تحتوى على عدد (7) أَسِره مجهزة مع مونيتور ووصلات الأكسجين ورسم القلب وقياس نسبه الأكسجين بالدم وقياس الضغط.
العيادات الخارجية
توجد بمبنى العيادات الخارجية وتعمل طوال أيام العمل الإسبوعى للقسم ومتواجد بها مدرس مساعد يومياً وتقوم بتوقيع الكشف على المترددين من المرضى.
القسم الداخلى
غرفتين كل غرفه بها عدد (3) أَسِره، غرفة تعمل داخلى رجال والأخرى داخلى حريم.